DNA實驗室分為四個相對獨立的區域： DNA 提取區、 PCR 擴增區、 檢測區和檢材保存實驗數據分析處理區。

原始試劑混配室：應為正壓間，在微環境百級超凈臺內操作，以防止其他程序功能間對本操作間的污染。

DNA提取室：應為微負壓間，設置排風系統，以防止核酸提取時可能產生的氣溶膠對人員的侵害和對其他程序功能間的擴散污染。

PCR擴增室：同樣應為微負壓間，設置排風系統，以防止大量擴增產物對其他程序功能間的擴散污染。

檢測室：為微負壓間，設置排風系統，以防止擴增產物在電泳測序過程中的擴散污染。

緩沖間：如設置緩沖間，功能間內可均為正壓，而在緩沖間內設置負壓，氣流從其雙道門的門縫處分別向緩沖間內流動，以合理的氣流組織方式避免各功能間的交叉污染。

實驗室應設置實驗區和辦公區。實驗區應包括試劑儲存、準備及配制區，檢材保管區、檢材前處理區、DNA提取區、擴增準備區、擴增區、擴增產物檢測區、數據分析區等，建有數據庫的實驗室應設置DNA數據庫工作區，相鄰區域進行有效隔離。對于DNA提取區，法醫生物檢材和比對樣本的DNA提取應在不同區域進行分離；涉及微量、腐敗物證檢材檢驗的實驗室，應另設專門區域進行DNA提取。對于開展二代測序檢驗的實驗室，應另設置文庫構建區、核酸定量區。對于開展RNA、蛋白質等檢驗項目的實驗室，應另設置專門的工作區。

實驗室內溫度、濕度和潔凈度控制應能滿足儀器正常運行和不同實驗程序的需要。實驗室應滿足生物樣品保存的要求，配備必要的溫度、濕度控制設備以及安全設施。為防止氣溶膠的污染，實驗室應定期通風和消毒。各區域應有明確的區域標記，避免不同工作區域內的設備、物品混用。檢驗鑒定流程應單向流動，必要時實現人員的單向流動。實驗室應設有限制進入的標識和相應措施，防止未授權者訪問。實驗室應制定廢棄樣品和有害廢棄物處置的程序。

有潔凈度、 壓力梯度、恒溫恒濕等特殊要求的實驗室凈高為 2.5 米-2.7 米，實驗室走廊凈寬為 2.5 米-3.0 米.

功能間均為正壓，DNA提取室、PCR擴增室為微負壓，緩沖間設置負壓，氣流從其雙道門的門縫處分別向緩沖間內流動，特殊實驗區采用非單向流、三級過濾、各自獨立送/回風、集中（或獨立）新/排風的凈化系統。

實驗室應根據所處理的生物樣本的危害程度，采取相應的生物安全防護措施，如配備生物安全柜、高壓滅菌器等。工作人員應接受生物安全培訓，掌握正確的操作方法和防護技能。

DNA 實驗室在 10 萬級到萬級左右。 地板用 PVC 比較好， 相對耐用,花色也有選擇技巧,即使老化更換也簡便。 有些單位也采用環氧樹脂自流坪地面， 不過不推薦, 地板不耐磨， 且不容易維護和更新。

單人單面的工作空間中，走道間距應不小于1200mm，置物高度約1500mm，操作間隙約750mm。

雙人雙面的工作空間中，走道間距應不小于1500mm，置物高度和操作間隙同上。

安全設備間的走道間距應大于6英尺（約1800mm）。

主實驗室的潔凈度達到CLASS7，輔助間的潔凈度達到CLASS8.3。實驗區域內地面應選用優質復合型/通體型PVC地面，多層工藝處理，PVC無縫焊接，防滲漏、防腐蝕、易清潔。

DNA實驗室設計規范涉及多個方面，需要綜合考慮實驗室的布局、氣路、安全、潔凈度、溫濕度、照明、電氣以及裝修材料等多個因素。以確保實驗環境的舒適性、安全性和實驗結果的準確性。