無菌實驗室的裝修設計要以實驗環境的潔凈度、安全性和實驗結果的準確性為前提，通過科學合理的裝修設計和管理制度，可以確保無菌實驗室的潔凈度、安全性和實驗結果的準確性。
無菌實驗室的布局通常由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六部分組成。分流設計，避免交叉污染。
無菌室設計內、外間，內間為無菌室，外間為緩沖室。無菌室面積一般控制在45平方米，緩沖室面積可小于無菌室，用于減少無菌室與外界的接觸。物流通道設計潔凈度十萬級和萬級的緩沖間，人流通道包含十萬級緩沖間、更衣室和風淋室。
工作人員進入無菌室前應在更衣室穿戴好滅菌的衣、帽、鞋，經過凈化風淋室，再到緩沖間，然后進入無菌室進行檢驗工作。
設計層流凈化系統，通過粗、中、高效三種不同孔徑的過濾膜對空氣進行過濾，確保實驗室的潔凈度。采用頂部送風、下側回風的氣流組織方式，空氣流向從清潔區流向非清潔區。保證實驗室恒溫、恒濕、新風量和潔凈度要求。換氣量應大于3次/小時。
裝修材料無毒、防滑、不滲水、不吸水、無裂隙且易于清洗消毒。無菌實驗室應有充足的自然采光或人工照明，照明要使用凈化燈組，設置紫外燈等消毒設備，定期對實驗室進行空氣和表面消毒。
通過一系列的凈化手段和凈化設備，確保實驗室內部環境達到無菌狀態，無菌實驗室的裝修設計要滿足高標準的潔凈度和無菌環境，以滿足微生物學、生物醫學等領域的研究和檢測需求。
